甲斐奈神社（かいなじんじゃ）は、山梨県笛吹市一宮町橋立にある神社。式内社論社、甲斐国総社論社。旧社格は村社。
国府推定地の1つ付近に鎮座する。周辺には一宮の浅間神社や国分寺・国分尼寺跡が残り、甲斐国の中心地であったことがうかがわれる。
『甲斐国志』によれば、天正10年（1582年）6月からの武田遺領を巡る天正壬午の乱において相模国の北条氏直と徳川家康が甲斐へ侵攻し、別当の大井摂元がは北条方に属したという。このため、甲斐奈神社は徳川方の先手衆により襲撃され、焼失したという。甲斐奈神社には神社全体を巨大な土塁で囲んだ筑前原塁跡が残されている・江戸時代には「神祖明神」・「林部宮」・「橋立明神」という別称があった。
明治40年、近代社格制度において村社に列格。
かつて境内の本殿裏手には「橋立大杉」という著名な大杉があったが、昭和28年に枯死し現在は石碑が立っている。