長久寺（ちょうきゅうじ）は、滋賀県彦根市にある真言宗豊山派の寺院。山号を普門山、院号を常心院とする。
1041年（長久2年）、勅命（勅願）により後三条天皇の皇后の祈願所、即ち勅願寺として創建され、創建時の年号をもって寺名とした。創健当初から江戸時代初期までは天台宗の寺院であった。