六孫王神社（ろくそんのうじんじゃ）は、京都府京都市南区にある神社。旧社格は郷社。
清和源氏始祖の源経基を祭神とすることで知られる。多田神社（兵庫県川西市）、壺井八幡宮（大阪府羽曳野市）とともに「源氏三神社」の1つとされる。
社伝では、境内は源経基の邸宅「八条亭」の跡地であるといい、応和元年（961年）に経基が臨終の際に「死後は龍神となって邸内の池に住んで子孫の繁栄を祈るから、この地に葬るように」と遺言したという。そして、応和3年（963年）9月に嫡子の満仲が現社地に経基の墓所を建立し、その前に社殿を造営したのが当社の創建であるとしている。本殿後方に現在も残る石の基壇は、経基の廟であると伝わる。
鎌倉時代には、源実朝の妻の本覚尼がこの地に遍照心院（大通寺）を建立し、当社はその鎮守社とされたという。その後は戦乱などにより社殿を失い、経基の墓所だけが残されたとも伝える。
元禄13年（1700年）からは、江戸幕府により社殿の再興が進められた。元禄14年（1701年）には正一位の神階と権現号が授けられている。社殿の再建は宝永4年（1707年）をもって完了し、その社殿が現在まで伝わっている。
その後は江戸幕府の滅亡とともに衰微し、また神仏分離により大通寺とも分離した。大通寺境内は、明治44年（1911年）に国鉄の鉄道用地となったため移転している。
近代社格制度では、明治6年（1873年）8月に村社に列し、明治14年（1881年）12月に郷社に昇格した。