長元寺（ちょうげんじ）は、東京都文京区向丘にある日蓮宗の寺院。山号は高耀山。旧本山は身延山久遠寺、通師法縁。
加賀藩前田家の江戸の菩提寺として栄えた。
境内には画家・桜間青厓、書家・小島成斎、儒学者・野口犀陽等の墓所がある。