高桐院（こうとういん）は、京都府京都市北区紫野にある臨済宗大徳寺派の寺院。大本山大徳寺の塔頭のひとつである。開基（創立者）は細川忠興（三斎）、開山（初代住職）は玉甫紹琮（ぎょくほじょうそう）である。
戦国時代に智将として名を馳せ、茶人としては利休七哲の1人として知られる細川忠興（三斎）が父・細川藤孝（幽斎）のために慶長7年（1602年）建立した寺で、玉甫紹琮を開山とする。玉甫紹琮は幽斎の弟で、三斎のおじにあたる。創建については慶長6年（1601年）とも言うが、創建に際して春屋宗園が与えた偈（げ）に「寅十月十七日」とあり、干支の関係から慶長7年の創建とみられる。
正保2年（1645年）に83歳で没した忠興は、遺言によりその遺歯が高桐院に埋葬され、以後細川家の菩提寺として庇護される。