恵那神社（えなじんじゃ）は、岐阜県中津川市にある神社。式内社の恵奈神社である。
創建時期は不明。恵那山は天照大神の胞衣（えな　へその緒のこと）を納めた地であり、かつては恵那山自体が御神体であったという。この胞衣を洗い清めた池が恵那山麓にあるという。やがて神仏習合により、恵那権現とも称されたという。
元々は恵那山山頂が本宮、麓が前宮であったが、1620年（元和6年）に前宮を新たに造営し直したさい、本宮が奥宮、前宮が本宮に変更される。
1873年（明治6年）に郷社、1925年（大正14年）に県社となる。