大嶽山那賀都神社は山梨県山梨市三富上釜口の神社。
人皇十二代景行天皇の御代、日本武尊東夷御征定の砌、甲武信の国境を越えさせ給う時神助を蒙り、神恩奉謝の印として国司ヶ岳の天狗尾根（２，１５９Ｍ）に佩剣を留め置き三神を斎き祀る。（現・奥宮）
第四十代天武天皇の御代、役行者小角当山（現・社地）の霊験なるを以て修験道場として開山、不思議にも昼夜連日鳴動して止まず、以来当山を「大嶽山鳴渡ヶ崎」と呼ぶ。第四十四代元正天皇養老元丁巳年（７１７年）三月十八日奥宮より遷座す。
天平七年行基、観世音像（昭和二十五年流失）を刻し、『赤の浦　鳴渡ヶ崎に那留神のみゐづや高く　那賀都とは祈る』との神歌を奉じ、是より当社を「那賀都神社」と称したと伝えられる。又、養老元年最澄、天長八年空海相次いで来たり、清浄ヶ滝・座禅岩、下流川浦に絵書石等の行跡を残す。
江戸初期大破に及ぶ事有り小祠となるが、元文五庚申年再建の為、羽黒派修験東叡山支配となり社殿残らず建立す。
今の本殿は嘉永三年着工、明治十年竣工、他社殿神楽殿は同三十五年（流失昭和三十六年復興）・随神門同三十七年竣工、何れも甲府三日町の名医 喜多島宗甫氏の奉納。
彫刻は都留市谷村の名匠 福田俊秀氏が当社に半生を篭もり手掛けた秀作。拝殿は同四十三年再建。
明治六年村社に列せられ、昭和五十七年本殿が旧三富村文化財に指定。