新宿十二社熊野神社（しんじゅくじゅうにそうくまのじんじゃ）は、東京都新宿区西新宿二丁目にある神社。新宿総鎮守として知られている。
中野長者と呼ばれた室町時代の紀州出身の商人・鈴木九郎によって応永年間（1394年 - 1428年）に創建されたものと伝えられている（異説もあり）。鈴木九郎は当初自身のふるさとである熊野三山の若一王子を祀ったところ、商売が成功し家運が上昇したので後に熊野三山から十二所権現をすべて祀るようになったのが始まりとされている。付近の地名「十二社」（じゅうにそう）はこれに因んでいる。この地名は現在でも通り（十二社通り）や温泉（新宿十二社温泉）の名などに見られる。
神社境内には大きな滝があり、また隣接して十二社池と呼ばれていた大小ふたつの池があり、江戸時代には付近は江戸近郊の景勝地として知られていた。江戸時代には熊野十二所権現社と呼ばれていた。
明治時代に入り名が熊野神社となり、神社の滝や十二社池は淀橋浄水場の造成や付近の開拓により姿を消し景勝地としての様相は徐々に見られなくなっていった。しかし、熊野神社はその後付近が日本有数の高層ビル街と変貌した現在でも新宿一帯の守り神として人々から信仰を得ている。