由良湊神社は兵庫県洲本市由良3丁目5-2の神社。
創立年代不詳。由良水門の鎮護として祀られたものとされる。
近世、成山城城主の池田忠長が、現由良小学校地に在った八幡宮を再興して氏神と定め、由良湊神社を境外摂社とした。
次いで、阿波・淡路両国の領主蜂須賀氏も成山城を居城としたが、寛永年間に「由良引け」を断行し、国府が洲本へ移った。この時、藩邸を築く為に八幡宮を湊神社の境内に移して社殿を造営した。
明治３年に両社を合併して、延喜式の社名「由良湊神社」と称し、現在に至る。