十二所神社（じゅうにしょじんじゃ）は、兵庫県姫路市にある神社。医薬の神様で、神徳は病気平癒など。
末社に、播州皿屋敷の主人公お菊（菊姫命）を祀ったお菊神社がある。お菊が十二所神社に参詣していたという伝承から祀られているようである。蓬や菊は薬草でもあり、医薬の神としての菊を祀った神社に、お菊伝説が重ねられて「お菊神社」になったとも考えられる。